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更新时间:2019-03-23 23:55:00

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  MEGA进化树是一款免费的分子进化遗传分析软件,它可以用于生物信息学实验分析进化树图使用,还可以用于分析来自物种和种群的DNA和蛋白质序列数据,可用于序列比对、进化树推断、估计分子进化速度、验证进化假说等,软件输入数据的格式比较简单,在众多遗传学分析软件中是比较容易制作的一种,非常适合生物学家和科研人员轻松的进行进化分析和分子鉴定,喜欢的赶快来试试吧!

MEGA进化树

【功能特点】

  1、【序列分析】

  系统发育推论

  型号选择

  约会和时钟

  祖传国家

  选择和测试

  序列比对

  2、【统计方法】

  最大似然

  距离方法

  普通最小二乘

  最大的简约

  复合似然

  贝叶斯

  3、【强大的视觉工具

  对齐/跟踪编辑器

  树探索者

  数据探索者

  传奇发电机

  基因复制向导

  时间树向导

MEGA进化树

【使用教程】

  1、首先根据提示安装好软件之后,准备需要建树的序列,并将序列保存为fasta格式。

  2、打开MEGA7,点击Align--Edit/built Alignment,选择Create a new alignment,点击ok。

  3、打开刚刚保存下来的fasta序列。

  4、点击Alignment –Align by ClustalW ,选择所有序列,出现下图,参数根据需求修改,在这我们就直接选择默认,点击ok。

  5、比对完成后,点击Data –Phylogenetic Analysis,出现下图坐标箭头指向的两个按钮。

  6、点击Phylogeny,有5个构建进化树的方法,一般选择MaximumLikehood(最大似然法)、Neighbor-Joining(邻接法)和Minimum-Evolution(最小进化法)方法,在此选择选择Neighbor-Joining(邻接法)建树。

  7、在Test of Phylogeny 选择Bootstrapmethod; No.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择Poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing Data Treatment 选择Compeledeletion, 点击Compute得到下面结果,根据自己的需求对树进行修饰。

【下载地址】

MEGA进化树 V7.0.26 官方最新版



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