七道奇
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软件大小:5.00 MB 下载次数:100
更新时间:2019-06-22 02:56:00

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  Arlequin是款专业的人类遗传学数据分析软件。有遗传学有兴趣的用户可以通过软件对统计数据中信息的挖掘,可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等。有喜欢的用户不要错过了。

Arlequin

【主要功能】

  1、Molecular diversity(分子多态性)

  2、Mismatch distribution(错配分布)

  3、Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计)

  4、Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联)

  5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡)

  6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验)

  7、Fu`s neutrality test(Fu中性检验)

  8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验)

  以上三个中性检验都是基于无限位点模型,适用于DNA sequence 和 RFLP单倍型。

  9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等)

  10、Minimu Spanning Network(MSN,最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异)

  11、AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构

  12、Pairwise genetic distances (遗传距离的估计)

  13、Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布)

  14、Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中)

【下载地址】

Arlequin(人类遗传学数据分析工具) V3.5.2.2 官方版



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