七道奇
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软件大小:5.00 MB 下载次数:101
更新时间:2022-05-26 23:21:00

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  cytoscape3.9.1是一款功能十分强大的生物科学数据分析软件,该软件专门为从事生物科学研究行业的用户量身定制,软件拥有人性化的UI用户界面,操作简单易上手,能够帮助用户高效率地完成图形化的生物数据分析,并且自动生成图表分析结果,大大提高用户的工作效率,有需要的小伙伴千万不要错过哦。

cytoscape3.9.1

【功能介绍】

  公共数据库客户端

  Cytoscape是作为一个网络服务客户端工作的,这意味着Cytoscape可以直接连接外部公共数据库,导入网络和注释数据。这意味着Cytoscape可以直接连接到外部公共数据库,并导入网络和注释数据。目前,我们支持Pathway Commons, IntAct, BioMart和NCBI Entrez Gene。我们还将继续为热门数据库开发新的服务客户端。

  互操作性

  由于Cytoscape支持导入/导出标准文件格式,你可以很容易地将Cytoscape放入你的工作流程中。例如,如果你有一个由 igraph 或 Bioconductor 生成的网络数据,Cytoscape 可以将该文件以文本表的形式加载,并以 PSI-MI 格式导出,供其他生物信息学工具或你自己的应用程序/脚本使用。

  从 3.3 版本开始,Cytoscape 支持 RESTful API 的编程访问。你可以使用你选择的编程语言来访问Cytoscape的核心功能,如创建网络,应用布局,或图像导出。

  会话文件

  你可以通过一键保存你的工作。所有的设置、数据文件和可视化都打包在一个会话文件中。它被称为Cytoscape会话(.cys)文件。Cytoscape 会话文件包括网络、属性(节点/边缘/网络)、桌面状态(选择/隐藏节点和边缘、窗口大小)、属性、一些插件状态和可视化风格。

  布局

  在二维空间布局网络。 有多种布局算法可供选择,包括循环、树形、力导向、边缘加权和yFiles有机布局。您也可以使用类似于其他图形应用程序用户界面的手动布局工具。

cytoscape3.9.1

【软件特色】

  以多种多样规范格式载入分子结构和基因遗传相互影响数据集

  新项目和集成化全局数据集和作用注解

  在这种数据信息中间创建强劲的可视化投射

  应用体细胞主视图应用软件实行高級剖析和建模

  可视化和剖析人为因素方案策划的路径数据集,如维基百科路径、核反应堆和KEGG。

【下载地址】

cytoscape(生物科学数据分析软件) V3.9.1 官方版



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