cytoscape3.9.1是一款功能十分强大的生物科学数据分析软件，该软件专门为从事生物科学研究行业的用户量身定制，软件拥有人性化的UI用户界面，操作简单易上手，能够帮助用户高效率地完成图形化的生物数据分析，并且自动生成图表分析结果，大大提高用户的工作效率，有需要的小伙伴千万不要错过哦。

【功能介绍】

　　公共数据库客户端

　　Cytoscape是作为一个网络服务客户端工作的，这意味着Cytoscape可以直接连接外部公共数据库，导入网络和注释数据。这意味着Cytoscape可以直接连接到外部公共数据库，并导入网络和注释数据。目前，我们支持Pathway Commons, IntAct, BioMart和NCBI Entrez Gene。我们还将继续为热门数据库开发新的服务客户端。

　　互操作性

　　由于Cytoscape支持导入/导出标准文件格式，你可以很容易地将Cytoscape放入你的工作流程中。例如，如果你有一个由 igraph 或 Bioconductor 生成的网络数据，Cytoscape 可以将该文件以文本表的形式加载，并以 PSI-MI 格式导出，供其他生物信息学工具或你自己的应用程序/脚本使用。

　　从 3.3 版本开始，Cytoscape 支持 RESTful API 的编程访问。你可以使用你选择的编程语言来访问Cytoscape的核心功能，如创建网络，应用布局，或图像导出。

　　会话文件

　　你可以通过一键保存你的工作。所有的设置、数据文件和可视化都打包在一个会话文件中。它被称为Cytoscape会话（.cys）文件。Cytoscape 会话文件包括网络、属性(节点/边缘/网络)、桌面状态(选择/隐藏节点和边缘、窗口大小)、属性、一些插件状态和可视化风格。

　　布局

　　在二维空间布局网络。 有多种布局算法可供选择，包括循环、树形、力导向、边缘加权和yFiles有机布局。您也可以使用类似于其他图形应用程序用户界面的手动布局工具。

【软件特色】

　　以多种多样规范格式载入分子结构和基因遗传相互影响数据集

　　新项目和集成化全局数据集和作用注解

　　在这种数据信息中间创建强劲的可视化投射

　　应用体细胞主视图应用软件实行高級剖析和建模

　　可视化和剖析人为因素方案策划的路径数据集，如维基百科路径、核反应堆和KEGG。